می‏گویند حضرت امیر علیه‏السلام در سفر نهروان شبی در این منزل فرموده‏اند. کشیشی از نصارا، بُراثا نام، در این محل ساکن بوده است. به دست حضرت قبول اسلام نموده؛ به این مناسبت این مسجد را مسجد براثا نامند.و اما وجه تسمیه سنگ علی: باز می‏گویند در همان سفر، شبی که در این جا منزل فرمودند، همراهان را از خوردن آب دجله منع فرموده و فرمودند: آشامیدن این آب، دل را سیاه کند و گردن را قوی. جماعتی که بودند عرض کردند که در این بیابان آبی جز دجله یافت نمی‏شود. سنگی در آن زمین بود.حضرت به دست مبارک آن سنگ را حرکت داده، چشمه آبی ظاهر شد. آن شب همه کس از آن چشمه آب برداشته، رفع ضرورت کردند. فردا آب چشمه خشک شد. به این جهت آن موضع را سنگ علی نامند.